برای تامین آب مورد نیاز با توجه به نزدیکی محل احداث پالایشگاه به دریا، پروژه آبگیر با ظرفیت 200 هزار متر مکعب در ساعت ایجاد شده که از نظر ظرفیت دومین پروژه آبگیر کشور است. این واحد در فاصله 6 کیلومتری جنوب پالایشگاه در سواحل نیلگون خلیج فارس قرار دارد و از شهریور ماه سال 1394 مورد بهره برداری قرار گرفته است.
واحد آبگیر دارای دو بخش خشکی و دریا است و فرآیند آن به این صورت است که ابتدا آب دریا به وسیله چهار خط لوله قطور (هر یک به قطر 7/2متر) از فاصله یک‌هزار و 500 متری و عمق 16 متری دریا به ساحل منتقل و سپس توسط هشت پمپ به ظرفیت هر یک 12 هزار و 600 متر مکعب در ساعت و از طریق دو خط لوله به قطر 2/2 متر به پالایشگاه انتقال می‌یابد و در نهایت با رعایت تمام قوانین و ضوابط زیست‌محیطی از طریق کانال برگشت به دریا بازگردانده می‌شود.
